Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DysfQ9ESD7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms