Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms