Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Smg9Q9DB90 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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