Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc54Q9DAL3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms