Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e2Q9D902 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e2Q9D902 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms