Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms