Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpcat2bQ9D5U0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms