Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f1Q9D5Q6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms