Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7Q9D541 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms