Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf6Q9D4J7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms