Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrnp35Q9D384 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrnp35Q9D384 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms