Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krtap5-3Q9D226 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms