Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms