Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
3100002H09RikQ9CXW6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
3100002H09RikQ9CXW6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms