Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms