Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly6kQ9CWP4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6kQ9CWP4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms