Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NmbQ9CR53 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms