Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc43Q9CR29 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc43Q9CR29 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc43Q9CR29 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc43Q9CR29 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 428.2 ms