Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQC3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms