Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms