Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms