Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe41Q99PV5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms