Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms