Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arl4dQ99PE9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl4dQ99PE9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms