Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms