Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins4Q99LZ3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms