Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms