Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms