Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms