Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec3Q99J72 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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