Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Clip1Q922J3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Clip1Q922J3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms