Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms