Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms