Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2aQ8R0A6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms