Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q7

Cerk, Ceramide kinase, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerkQ8K4Q7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CerkQ8K4Q7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CerkQ8K4Q7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CerkQ8K4Q7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CerkQ8K4Q7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CerkQ8K4Q7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CerkQ8K4Q7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CerkQ8K4Q7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms