Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z0

Nod2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nod2Q8K3Z0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nod2Q8K3Z0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nod2Q8K3Z0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nod2Q8K3Z0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nod2Q8K3Z0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nod2Q8K3Z0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms