Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms