Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssh3Q8K330 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms