Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brd3Q8K2F0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms