Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms