Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sde2Q8K1J5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms