Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh3Q8K1E6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh3Q8K1E6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms