Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc87Q8CDL9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms