Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrn3Q8CBC6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms