Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms