Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CrbnQ8C7D2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CrbnQ8C7D2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms