Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek11Q8C0Q4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek11Q8C0Q4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms