Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trerf1Q8BXJ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms