Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Larp4Q8BWW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Larp4Q8BWW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms