Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TicrrQ8BQ33 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TicrrQ8BQ33 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TicrrQ8BQ33 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms